拉曼你懂,流式你也熟,那“拉曼流式”呢?一项让细胞从此告别“贴标签”的黑科技
2026.05.06
做细胞实验的人大概都有过这种崩溃:辛辛苦苦养的细胞,为了做流式分选,得先折腾大半天染荧光;染完了发现细胞死了一半,剩下的也被抗体折腾得半死不活;好不容易拿到数据,又因为荧光串色,对着补偿矩阵调到怀疑人生。更别提那些根本染不上荧光的厚壁细菌、微藻,还有绝对不能碰任何外源物质的治疗用干细胞。传统荧光流式在这些场景里,简直是 "巧妇难为无米之炊"。
配图说明:完整展示了传统流式的核心流程:细胞经荧光抗体标记后,在鞘液包裹下单列通过激光检测区,通过收集荧光信号识别细胞,再通过电场偏转实现分选。来源:《Raman Flow Cytometry and Its Biomedical Applications》https://doi.org/10.3390/bios14040171
好在常规拉曼流式细胞术(自发拉曼流式)的出现,彻底打破了这个僵局。它把拉曼光谱能 "看穿" 细胞化学组成的本事,和流式细胞术高通量单细胞操控的优势捏在了一起,让我们不用给细胞贴任何标签,就能看清每个细胞的真实面目,还能精准把想要的细胞挑出来。现在,这项技术已经成了无标记细胞分析领域最硬核的方向之一,正在悄悄改变很多生物医学研究的玩法。
图:单细胞生物分析技术概述
配图说明:该图将所有单细胞技术清晰划分为 "间接标记法"(荧光成像、FACS)和 "直接检测法"(拉曼成像、拉曼激活细胞分选 RACS)两大类,直观展示了拉曼技术无需外源标记的核心优势,也是它能解决传统流式所有痛点的根本原因。来源:《Single cell Raman spectroscopy for cell sorting and imaging》DOI 10.1016/j.copbio.2011.11.019其实原理说穿了特别接地气:每个细胞里的蛋白质、脂质、核酸、碳水化合物这些东西,分子振动的频率都是独一无二的。就像每个人的指纹不一样,不同分子被激光照到的时候,散射出的光频率的变化也不一样,这就是1928年发现的拉曼效应。传统荧光流式是靠你提前贴上去的荧光染料发光来识别细胞,相当于给每个细胞戴个有颜色的帽子,然后数帽子认人。而拉曼流式直接 "读" 细胞本身的分子振动信号,不用任何外源标记。比如看到 2850 cm⁻¹ 的强峰,就知道这个细胞里脂质含量高;看到 1655 cm⁻¹ 的峰,对应蛋白质的酰胺键;看到 1001 cm⁻¹ 的特征峰,那就是苯丙氨酸。把这些峰拼在一起,就是每个细胞独一份的 "化学身份证",不仅能区分细胞类型,还能精准判断它的代谢状态、分化阶段,甚至有没有发生癌变。《Raman Flow Cytometry and Its Biomedical Applications》 10.1016/j.copbio.2011.11.019上图全球第一台拉曼流式的经典系统架构,也是目前所有常规拉曼流式的基础。核心组件包括 532nm 激发激光器、微流控芯片、聚焦与收集物镜、光栅光谱仪和高灵敏度 CCD 探测器。细胞在微流控通道中单列通过激光焦点,系统实时采集每个细胞的全光谱拉曼信号,经计算机解析后完成细胞识别与分选。整个流程和传统流式大同小异:细胞在鞘液的包裹下排成单列,挨个通过激光检测区。只不过原来收集荧光信号的地方,换成了拉曼光谱仪和高灵敏度的 CCD 探测器。系统会给每个细胞拍一张 "光谱快照",电脑一秒钟就能解析出它的化学组成,然后根据你设定的筛选条件,用微流控、介电泳或者光镊技术,把目标细胞精准分到收集管里。当然,早期的拉曼流式也特别拉胯。因为自发拉曼信号天生就弱,只有约百万分之一的光子会发生非弹性散射,所以最早 2008 年问世的第一台拉曼流式,测一个细胞要好几秒,一小时才能测几千个,根本没法和传统流式每秒十万个的速度比。不过这十几年里,大家一直在死磕技术:从优化激光功率和光学系统,到用微流控技术让细胞更精准地通过激光焦点,再到开发更高效的信号降噪算法,现在成熟的常规拉曼流式系统,比如 2023 年推出的,已经能做到每分钟分析 30 个癌细胞,虽然还是比荧光流式慢,但已经能满足大部分科研场景的需求了。说白了,拉曼流式所有的好处,都来自这五个字。这一下就解决了传统荧光流式几十年都没搞定的几个老大难问题。首先,它能告诉你的信息多太多了。传统流式最多同时测十几个指标,还都是你提前想好要测的特定蛋白,相当于拿着一张清单去核对,清单上没有的东西,你根本发现不了。而拉曼流式一上来就给你一张全光谱,几十上百个峰,从核酸、蛋白质到脂质、代谢物,细胞里有什么、有多少,全都一目了然。它不是在 "找你已知的东西",而是在 "告诉你细胞里有什么"。比如同样是乳腺癌细胞,有的脂质代谢异常旺盛,有的核酸合成速度快,这些代谢上的细微差别,荧光流式根本看不出来,但拉曼流式一眼就能分辨,还能据此把不同亚型的癌细胞分开。其次,它什么细胞都能测。那些厚壁的金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌,荧光抗体根本穿不透它们的细胞壁;肿瘤微环境里的低氧细胞,pH 值不对,荧光标记根本结合不上;还有 CAR-T 细胞、诱导多能干细胞(iPSCs)这些要用到人身上的治疗细胞,谁敢往里面加外源抗体啊?万一引发免疫反应,后果不堪设想。这些传统流式搞不定的硬骨头,拉曼流式全都能轻松拿下。而且因为不用对细胞做任何固定、透化处理,测出来的结果才是细胞最真实的生理状态,不会因为标记过程引入任何误差。更重要的是,它对细胞特别友好。荧光标记不仅要折腾细胞,还要用高能量的紫外光激发,很多细胞扛不住这通折腾,测完就死了。而拉曼流式用的是低光毒性的激光,也不用对细胞做任何预处理,分选出来的细胞活蹦乱跳的,拿回去就能继续培养、扩增,甚至直接用于后续的功能实验。这对干细胞研究来说简直是救命的优势,毕竟你总不能把死细胞拿去做分化实验,更不能打到病人身上。还有一个特别实用的点:它不会光漂白。荧光染料照几次就不亮了,长时间动态监测根本做不了。但拉曼信号是分子本身的固有性质,只要分子还在,信号就永远不会消失。你可以连续监测细胞培养好几天,看着它们慢慢分裂、分化、代谢变化,这是荧光技术想都不敢想的。正是因为这些无可替代的优势,常规拉曼流式现在已经渗透到了生物医学的各个角落,解决了很多以前根本解决不了的问题。配图说明:该图直观展示了拉曼流式最成熟的三个应用方向:(a) 癌细胞的无标记检测与分类;(b) 基于分子特征的干细胞精准分选;(c) 微生物细胞的代谢状态分析与亚群区分。这三个方向也是目前常规拉曼流式在科研中使用最广泛的领域。来源:《Raman Flow Cytometry and Its Biomedical Applications》https://doi.org/10.3390/bios14040171
在癌症研究里,它成了解析肿瘤异质性的利器。不用找什么稀有的肿瘤标志物,直接看癌细胞的代谢特征就能把它们区分开。2023 年中科院团队开发的 pDEP-DLD-RFC 系统,通过全光谱单细胞拉曼分析,成功区分了膀胱癌、肺癌、肾癌和乳腺癌等多种癌细胞系,还能精准识别不同代谢状态的癌细胞亚群。这不仅能帮助我们更深入地理解癌症的发生发展机制,还能为个性化治疗提供依据 ,毕竟不同代谢亚型的癌细胞,对药物的反应也不一样。https://doi.org/10.1002/advs.202207497
在干细胞治疗领域,它更是成了质量控制的关键技术。干细胞的异质性一直是个大麻烦,同一批培养的干细胞,有的能分化成心肌细胞,有的能分化成神经细胞,还有的根本不会分化,传统方法根本没法区分。用拉曼流式,只要看细胞里蛋白质、脂质和核酸的比例,就能精准挑出那些多能性最好、分化潜力最强的干细胞,而且分选出来的细胞完全没有被外源物质污染,直接就能用在后续的细胞治疗研究中。做微生物的人更是把它当成了宝贝。以前鉴定细菌要先培养好几天,很多环境中的细菌还根本养不活,导致我们对 99% 以上的微生物一无所知。现在用拉曼流式,直接把环境样本或者临床样本滴上去,不用培养,就能逐个分析每个细菌的化学组成,几分钟就能知道里面有什么菌。结合重水标记技术,还能通过 2000-2300 cm⁻¹ 的 C-D 特征峰,快速识别哪些细菌是活的、代谢活跃的,哪些已经产生了抗生素耐药性。以前要等两三天才能出的药敏结果,现在几个小时就能搞定,病人能早好几天用上对症的抗生素。还有药物研发,以前筛药都是简单粗暴地看细胞死没死,根本不知道药物是怎么起作用的。现在用拉曼流式,能直接看到药物处理后细胞内各种生物分子的变化,知道药物到底影响了哪个代谢通路,有没有脱靶效应。这不仅能加快新药研发的速度,还能提前发现药物的毒副作用,减少临床试验的失败率。当然,常规拉曼流式也不是完美的,现在还有几个坎没迈过去。最头疼的还是信号弱、灵敏度低,低丰度的生物分子,比如细胞里的信号蛋白、小分子药物,浓度太低的话,拉曼信号就会被背景噪声淹没,根本测不到。还有通量问题,虽然现在已经比早期提高了很多,但和传统荧光流式每秒十万个的速度比,还是差了好几个数量级,筛大样本库的时候还是有点力不从心。另外,现在的拉曼流式仪器操作也需要一定的专业知识,普通实验室还没法像荧光流式那样普及。不过这些问题都在慢慢解决。现在大家在搞各种信号增强技术,比如优化激光聚焦系统、开发更高灵敏度的探测器,还有用机器学习算法来降噪和解析光谱,以后灵敏度和速度肯定会越来越高。仪器也在往小型化、自动化的方向走,说不定再过几年,每个实验室都能有一台操作简单、价格亲民的拉曼流式。其实回头看,荧光流式从发明到普及,也花了几十年的时间。常规拉曼流式现在才发展了十几年,就已经取得了这么大的突破,未来的潜力不可限量。它不仅是一项更好的细胞分析技术,更是给了我们一个全新的视角去看细胞,不用再隔着荧光标签去猜细胞的状态,而是直接看到它们最真实的化学本质。也许再过十年,我们再回头看现在的荧光流式,就像现在看黑白电视一样古老。而拉曼流式,将会成为下一代细胞分析的标配,带领我们发现更多生命的奥秘。